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USTL

Fiche d’identité

par Guillaume van der Rest - 16 mai 2010

  • Laboratoire : Miniaturisation pour l’Analyse, la Synthèse et la Protéomique (MSAP), CNRS USR 3290
  • Responsable de site : Christian ROLANDO
  • Correspondant scientifique : Caroline TOKARSKI
  • Responsable de l’accueil : Fabrice BRAY
  • Spectromètre : Bruker hybride APEX, aimant 9,4 Tesla, h-Q-h
  • Méthodes d’ionisation : nano ESI
  • Méthodes d’activation : CID en cellule hexapolaire, SORI-CID, IRMPD, ECD.
  • Introduction d’échantillons, couplage Chromatographie : Chaîne nanoLC et colonnes peptides et protéines (phases inverses C4, C8, C18) et HILIC
  • Logiciels : Protéomique : serveur Mascot local. Bioinformatique de traitement des données quantitatives (Mascott Distiller, Progenesis LC)
  • Matériels complémentaires Accès à la Plateforme IBISA pour la préparation ou le contrôle des échantillons

Spécificités, expérience

Protéomique bottom up.

Protéomique quantitative (SILAC, label-free)

Modifications post-traductionnelles (phosphorylation, glycosylation, citrullination…), localisation ponts disulfures)

Protéomique middle-down (ca 10 kDa) en couplage nanoLC

Lipidomique

Glycomique